Водная экология, секция гидробиологии МОИП, гидроэкология, лимнология, биологическая океанография, экотоксикология / aquatic ecology, limnology, biological oceanography, ecotoxicology
»
Обсуждения
Новые сведения о цианофагах - вирусах цианобактерий
дек 29, 2009 | 17:12
Сырчин, С. А.
Некоторые особенности структуры ДНК цианофага LPP-3 [Текст] / С. А. Сырчин, М. И. Менджул // Мiкробiол. ж. - 2002. - Т. 64, N 2. - С. 35-43
Ключевые слова:
ДНК
СТРУКТУРА
ВЫСТУПАЮЩИЕ 3'-КОНЦЫ
ФРАГМЕНТЫ
КЛОНИРОВАНИЕ
РЕСТРИКЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
КОНТРСЕЛЕКЦИЯ
ЦИАНОФАГИ LPP-3
Аннотация: Исследовали эффективность включения радиоактивной метки в 3'- и 5'-концы ДНК цианофага LPP-3 полинуклеотидкиназой T4 и терминальной трансферазой в различных условиях проведения реакции. Полученные данные свидетельствуют о том, что ДНК цианофага LPP-3 имеет выступающие 3'-концы. Эксперименты по лигированию нативных молекул ДНК LPP-3 указывают на то, что концы вирусного генома не проявляют свойств комплементарности. Проведено клонирование отдельных фрагментов ДНК LPP-3. Рестрикционный анализ клонированных фрагментов подтвердил предположение об отсутствии в геноме цианофага LPP-3 последовательностей GGGCC и GGCCC. Выдвинута гипотеза о подобной сайт-специфичности вирусной нуклеазы. Контрселекция генома цианофага LPP-3 позволяет считать его перспективным для использования в конструировании новых векторов клонирования в цианобактерии. Украина, Ин-т микробиол. и вирусологии НАНУ, Киев. Библ. 32
Полный список авторов: Сырчин, С.А.; Менджул, М.И.
2.
Сырчин, С. А.
Некоторые особенности структуры ДНК цианофага LPP-3 [Текст] / С. А. Сырчин, М. И. Менджул // Мiкробiол. ж. - 2002. - Т. 64, N 2. - С. 35-43
Ключевые слова:
ДНК
СТРУКТУРА
ВЫСТУПАЮЩИЕ 3'-КОНЦЫ
ФРАГМЕНТЫ
КЛОНИРОВАНИЕ
РЕСТРИКЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
КОНТРСЕЛЕКЦИЯ
ЦИАНОФАГИ LPP-3
Аннотация: Исследовали эффективность включения радиоактивной метки в 3'- и 5'-концы ДНК цианофага LPP-3 полинуклеотидкиназой T4 и терминальной трансферазой в различных условиях проведения реакции. Полученные данные свидетельствуют о том, что ДНК цианофага LPP-3 имеет выступающие 3'-концы. Эксперименты по лигированию нативных молекул ДНК LPP-3 указывают на то, что концы вирусного генома не проявляют свойств комплементарности. Проведено клонирование отдельных фрагментов ДНК LPP-3. Рестрикционный анализ клонированных фрагментов подтвердил предположение об отсутствии в геноме цианофага LPP-3 последовательностей GGGCC и GGCCC. Выдвинута гипотеза о подобной сайт-специфичности вирусной нуклеазы. Контрселекция генома цианофага LPP-3 позволяет считать его перспективным для использования в конструировании новых векторов клонирования в цианобактерии. Украина, Ин-т микробиол. и вирусологии НАНУ, Киев. Библ. 32
Полный список авторов: Сырчин, С.А.; Менджул, М.И.
3.
Сырчин, С. А.
Разработка метода мечения РНК in vitro с помощью терминальной трансферазы с целью получения гибридизационных зондов [Текст] / С. А. Сырчин, М. И. Менджул // Мiкробiол. ж. - 2002. - Т. 64, N 1. - С. 60-65
Ключевые слова:
РНК-ЗОНДЫ
ГИБРИДИЗАЦИЯ
ТЕРМИНАЛЬНАЯ ТРАНСФЕРАЗА
МЕТОДЫ
ЦИАНОФАГИ
ЦИАНОБАКТЕРИИ
Аннотация: Исследована возможность использования терминальной трансферазы для получения гибридизационных РНК-зондов. На модельном объекте - РНК фага MS2 отработаны оптимальные условия проведения реакции: 200 мМ какодилата калия, 1 мМ CoCl[2], 1 мМ DTT, pH 7,2, при значительном избытке фермента. Отработанный метод применяли для определения области ранних генов цианофага LPP-3. С этой целью из цианобактерии Plectonema boryanum CALU 465 выделяли суммарные препараты РНК, метили их с помощью терминальной трансферазы и ['альфа'{32}P]АТФ и использовали в качестве зондов при гибридизации с рестрикционными фрагментами ДНК LPP-3. По результатам блот-гибридизации по Саузерну сделан вывод, что KpnI-фрагмент генома цианофага LPP-3 размером 10 т.п.н. включает в себя ранние гены. Обсуждается возможность применения данного метода. Украина, Ин-т микробиологии и вирусологии НАН Украины, Киев, 03143. Библ. 29
Полный список авторов: Сырчин, С.А.; Менджул, М.И.
4.
Суханов, С. Н.
Вируснаправленное формирование полимеразного комплекса в системе цианофаг-цианобактерия [Текст] / С. Н. Суханов, М. И. Менджул // Микробиология. - 1999. - Т. 68, N 2. - С. 215-219
Ключевые слова:
ЦИАНОФАГИ
ДНК
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА
ИНГИБИТОРЫ
ЦИАНОБАКТЕРИИ
Аннотация: Изучено состояние основных компонентов ДНК-полимеразного комплекса цианобактерии Plectonema boryanum CALU 465 в динамике инфекции цианофага LPP-3. Показано, что изменения активности вирускодируемой ДНК-полимеразы Х коррелирует с опережением во времени с синтезом вирусспецифической ДНК, при этом подавление активности ДНК-полимеразы I осуществляется синхронно с процессом деградации хромосомальной ДНК цианобактерии. Выявлены отличия в физико-химических св-вах ДНК-полимераз I, II и X и чувствительности их активности к ингибиторам. На основе анализа полученных рез-тов и данных литературы предложена общая схема вируснаправленной модификации и функционирования ДНК-полимеразного комплекса инфицированных клеток P. boryanum. Украина, Ин-т микробиол. и вирусол. им. Д. К. Заболотного НАН Украины, Киев. Библ. 19
Полный список авторов: Суханов, С.Н.; Менджул, М.И.
5.
Суханов, С. Н.
Репликативный аппарат клеток цианобактерий Plectonema boryanum, инфицированных фагом LPP-3 [Текст] / С. Н. Суханов, М. И. Менджул // Мiкробiол. ж. - 1999. - Т. 61, N 4. - С. 31-39
Ключевые слова:
БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ LPP-3
ЦИАНОБАКТЕРИИ
PLECTONEMA BORYANUM
РЕПЛИКАТИВНЫЙ АППАРАТ
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА ДНК-ЗАВИСИМАЯ
Аннотация: Изучено состояние основных компонентов репликативного комплекса цианобактерии Plectonema boryanum CALU 465 в динамике инфекции, вызванной цианофагом LPP-3. Показано, что изменения активности ДНК-полимеразы X коррелируют с опережением во времени с синтезом вирусоспецифической ДНК, при этом подавление активности ДНК-полимеразы I осуществляется синхронно с процессом деградации хромосомальной ДНК цианобактерии. Выявлены отличия в физико-химических свойствах ДНК-полимераз I, II и X и чувствительности их активности к ингибиторам. На основе анализа полученных результатов и данных литературы предложена общая схема вируснаправленной модификации и функционирования репликативного аппарата инфицированных клеток P. boryanum
Полный список авторов: Суханов, С.Н.; Менджул, М.И.
6.
Сырчин, С. А.
Некоторые особенности структуры ДНК цианофага LPP-3 [Текст] / С. А. Сырчин, М. И. Менджул // Мiкробiол. ж. - 2002. - Т. 64, N 2. - С. 35-43
Ключевые слова:
ДНК
СТРУКТУРА
ВЫСТУПАЮЩИЕ 3'-КОНЦЫ
ФРАГМЕНТЫ
КЛОНИРОВАНИЕ
РЕСТРИКЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
КОНТРСЕЛЕКЦИЯ
ЦИАНОФАГИ LPP-3
Аннотация: Исследовали эффективность включения радиоактивной метки в 3'- и 5'-концы ДНК цианофага LPP-3 полинуклеотидкиназой T4 и терминальной трансферазой в различных условиях проведения реакции. Полученные данные свидетельствуют о том, что ДНК цианофага LPP-3 имеет выступающие 3'-концы. Эксперименты по лигированию нативных молекул ДНК LPP-3 указывают на то, что концы вирусного генома не проявляют свойств комплементарности. Проведено клонирование отдельных фрагментов ДНК LPP-3. Рестрикционный анализ клонированных фрагментов подтвердил предположение об отсутствии в геноме цианофага LPP-3 последовательностей GGGCC и GGCCC. Выдвинута гипотеза о подобной сайт-специфичности вирусной нуклеазы. Контрселекция генома цианофага LPP-3 позволяет считать его перспективным для использования в конструировании новых векторов клонирования в цианобактерии. Украина, Ин-т микробиол. и вирусологии НАНУ, Киев. Библ. 32
Полный список авторов: Сырчин, С.А.; Менджул, М.И.
7.
Менджул, М. I.
Порiвняльна характеристика нативних та iндукованих цiанофагами протеiназ цiанобактерiй Plectonema boryanum i Anabaena variabilis [Текст] / М. I. Менджул, С. I. Перепелиця // Мiкробiол. ж. - 2003. - Vol. 65, N 3. - С. 21-28
Перевод заглавия: Сравнительная характеристика нативных и индуцированных цианофагами протеиназ цианобактерий Plectonema boryanum и Anabaena variabilis
Ключевые слова:
PLECTONEMA BORYANUM (BACT)
ANABAENA VARIABILIS (BACT)
ЦИАНОБАКТЕРИИ
ПРОТЕИНАЗЫ
НАТИВНЫЕ
ИНДУЦИРОВАННЫЕ ЦИАНОФАГАМИ
СРАВНИТЕЛЬНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА
ЦИАНОФАГИ
LPP-3
РОЛЬ ПРОТЕИНАЗ В ВИРУСНОЙ ПАТОЛОГИИ
Аннотация: Изучены в сравнительном аспекте физико-химические и каталитические свойства протеиназ нативных и инфицированных клеток цианобактерии Plectonema boryanum. Установлено, что на ранних этапах репродукции цианофага LPP-3 в клетках цианобактерии P. boryanum формируется de novo протеиназный комплекс, состоящий, по крайней мере, из пяти ферментов. Вирусоиндуцированные протеиназы отличаются от протеиназ нативных клеток по ряду физико-химических характеристик и обладают более высокой каталитической активностью. Аналогичные вирусоиндуцированные изменения в протеиназном комплексе происходят и в системе цианобактерия Anabaena variabilis - цианофаг А-1. В работе обсуждаются возможные функции отдельных ферментов протеиназного комплекса в вирусной патологии клеток цианобактерий. Украина, Ин-т микробиологии и вирусологии НАН Украины, Киев. Библ. 21
Полный список авторов: Менджул, М.I.; Перепелиця, С.I.
8.
Роль укороченного пути и блока синтеза de novo пуринов и пиримидинов в обеспечении трифосфатами синтеза ДНК цианофагов S-8K, LPP-3 и A-1 [Текст] / Н. В. Нестерова [и др.] // Микробиол. ж. - 1991. - Т. 53, N 4. - С. 73-80
Ключевые слова:
БАКТЕРИОФАГИ
ЦИАНОФАГИ
ЦИАНОБАКТЕРИИ
СИНТЕЗ НУКЛЕОТИДОВ DE NOVO
ВЛИЯНИЕ ИНГИБИТОРОВ
Аннотация: Представлены данные по изучению синтеза нуклеотидов de novo в инфицированных Кл цианобактерий и по использованию продуктов вирусиндуцированной деградации клеточной ДНК в синтезе нуклеиновых к-т цианофагов. Установлено, что для синтеза вирусных нуклеиновых к-т в первой половине латентного периода используется пул нуклеотидов клеточного происхождения, во второй половине - пурины и пиримидины, синтезированные de novo. Исследовано влияние ингибиторов метаболизма пуринов и пиримидинов (азасерина и 5-азаоротата) на синтез вирусной ДНК. Выявлена корреляция между концентрациями ингибиторов, с одной стороны, и выживаемостью Кл цианобактерий, а также выходом вируса - с другой. Можно заключить, что в бактериальной Кл с разрушенным геномом активно функционирует мультиферментный комплекс биосинтеза нуклезидтрифосфатов de novo.
Полный список авторов: ; Нестерова, Н.В.; Менджул, М.И.; Калиниченко, Т.С.; Сырчин, С.А.
9.
Динамика аминокислотного пула цианобактерий Anabaena variabilis в ранний период развития цианофага А-1 [Текст] / Г. Х. Кадырова [и др.] // Микробиология. - 1995. - Т. 64, N 4. - С. 469-472
Ключевые слова:
CYANOPHYTA (ALGAE)
ANABAENA VARIABILIS (ALGAE)
ВИРУСНАЯ ИНФЕКЦИЯ
АМИНОКИСЛОТЫ
СОСТАВ
СОДЕРЖАНИЕ
ДИНАМИКА
Аннотация: Исследовано изменение содержания аминокислотного пула в инфицированных клетках цианобактерий Anabaena variabilis в динамике вирусной инфекции. В системе A-1-A. variabilis обнаружено 2 повышения аминокислотного пула - на 0 ч и 2 ч инфекции. Они могут быть следствием не только активации процессов протеолиза и результатом деградации цитоплазматических мембран, но и возникать за счет усиления вирусдетерминированных процессов биосинтеза аминокислот. Ил. 2. Библ. 11
Полный список авторов: ; Кадырова, Г.Х.; Мурадов, М.М.; Халмурадов, А.Г.; Колтукова, Н.В.; Менджул, М.И.
10.
Сырчин, С. А.
Разработка метода мечения РНК in vitro с помощью терминальной трансферазы с целью получения гибридизационных зондов [Текст] / С. А. Сырчин, М. И. Менджул // Мiкробiол. ж. - 2002. - Т. 64, N 1. - С. 60-65
Ключевые слова:
РНК-ЗОНДЫ
ГИБРИДИЗАЦИЯ
ТЕРМИНАЛЬНАЯ ТРАНСФЕРАЗА
МЕТОДЫ
ЦИАНОФАГИ
ЦИАНОБАКТЕРИИ
Аннотация: Исследована возможность использования терминальной трансферазы для получения гибридизационных РНК-зондов. На модельном объекте - РНК фага MS2 отработаны оптимальные условия проведения реакции: 200 мМ какодилата калия, 1 мМ CoCl[2], 1 мМ DTT, pH 7,2, при значительном избытке фермента. Отработанный метод применяли для определения области ранних генов цианофага LPP-3. С этой целью из цианобактерии Plectonema boryanum CALU 465 выделяли суммарные препараты РНК, метили их с помощью терминальной трансферазы и ['альфа'{32}P]АТФ и использовали в качестве зондов при гибридизации с рестрикционными фрагментами ДНК LPP-3. По результатам блот-гибридизации по Саузерну сделан вывод, что KpnI-фрагмент генома цианофага LPP-3 размером 10 т.п.н. включает в себя ранние гены. Обсуждается возможность применения данного метода. Украина, Ин-т микробиологии и вирусологии НАН Украины, Киев, 03143. Библ. 29
Полный список авторов: Сырчин, С.А.; Менджул, М.И.
Упрощенный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)