Research   Биологические науки

проект
Разработка системы однонуклеотидных полиморфных маркеров (SNP) для селекции кур по аллелям генов, влияющих на признаки качества скорлупы яйца

Публикации Участники Блог

Описание

Большинство хозяйственно ценных признаков домашних животных имеют сложный полигенный тип наследования и контролируются многими генами, расположенными в локусах QTL (quantitative trait loci). Изучение комплексной молекулярной архитектуры QTL представляет интерес с точки зрения общей генетики. Данные о нуклеотидных последовательностях из районов QTL могут быть использованы в практическом животноводстве для селекции на основе полиморфных вариантов генов, оказывающих решающее влияние на проявление хозяйственно-ценных признаков. Данное направление находится в рамках перечня областей применения результатов ориентированных фундаментальных исследований (раздел 6 – сельское хозяйство, подраздел - «молекулярно-генетических основы создания новых пород, линий, типов и кроссов животных и птицы»). В ходе выполнения НИР 06.01.01 на основе разработок, поддержанных РФФИ (93-04-20410-а, 00-04-48563-а, 01-04-49794-а, 03-04-48060-а), нами был проведен ряд экспериментов по позиционному клонированию района хромосомы 4 домашней курицы, содержащего QTL толщины скорлупы на 53 неделе жизни (ST53). Методом гибридологического анализа косегрегации микросателлитных ДНК-маркеров и количественных признаков определены маркеры интервала генетической карты (районов хромосом), контролирующего QTL ST53. Определены координаты двадцати клонов, имеющих гомологию последовательностей ДНК вставки с микросателлитными локусами MCW0170, LEI0081, MCW0114 и ADL0241. Методом флуоресцентной гибридизации ДНК-ДНК in situ (FISH) установлена их локализация на хромосоме 4. С использованием данных полного сиквенса выявлен интервал величиной 1,2 млн.п.н., являющийся критическим для признака ST53. Идентифицировано 16 генов, являющихся позиционными являющихся позиционными кандидатами для признака ST53. Предстоит оценить количественно экспрессию генов-кандидатов в яйцеводах животных, имеющих выраженные различия по изучаемому признаку; выявить возможные корреляции уровней экспрессии генов-кандидатов и количественных значений ST53; путем частичного секвенирования выявить SNP, по которым различаются аллели генов-кандидатов, влияющие на проявление этого признака. На основе полученных данных предполагается создать систему маркеров для селекции несушек по аллелям генов, оказывающих влияние на толщину скорлупы яйца. В настоящее время не существует подобной системы в птицеводстве. Аналогичные системы для прямой генной селекции по показателям качества мяса и молока применяют в свиноводстве и молочном животноводстве США и ЕС. Авторы проекта имеют более чем 15-летний опыт работы в области молекулярной генетики домашней курицы и сравнительной геномики птиц и млекопитающих.