Большинство хозяйственно ценных признаков домашних животных имеют сложный полигенный тип наследования и контролируются многими генами, расположенными в локусах QTL (quantitative trait loci). Изучение комплексной молекулярной архитектуры QTL представляет интерес с точки зрения общей генетики. Данные о нуклеотидных последовательностях из районов QTL могут быть использованы в практическом животноводстве для селекции на основе полиморфных вариантов генов, оказывающих решающее влияние на проявление хозяйственно-ценных признаков. Данное направление находится в рамках перечня областей применения результатов ориентированных фундаментальных исследований (раздел 6 – сельское хозяйство, подраздел - «молекулярно-генетических основы создания новых пород, линий, типов и кроссов животных и птицы»). В ходе выполнения НИР 06.01.01 на основе разработок, поддержанных РФФИ (93-04-20410-а, 00-04-48563-а, 01-04-49794-а, 03-04-48060-а), нами был проведен ряд экспериментов по позиционному клонированию района хромосомы 4 домашней курицы, содержащего QTL толщины скорлупы на 53 неделе жизни (ST53). Методом гибридологического анализа косегрегации микросателлитных ДНК-маркеров и количественных признаков определены маркеры интервала генетической карты (районов хромосом), контролирующего QTL ST53. Определены координаты двадцати клонов, имеющих гомологию последовательностей ДНК вставки с микросателлитными локусами MCW0170, LEI0081, MCW0114 и ADL0241. Методом флуоресцентной гибридизации ДНК-ДНК in situ (FISH) установлена их локализация на хромосоме 4. С использованием данных полного сиквенса выявлен интервал величиной 1,2 млн.п.н., являющийся критическим для признака ST53. Идентифицировано 16 генов, являющихся позиционными являющихся позиционными кандидатами для признака ST53. Предстоит оценить количественно экспрессию генов-кандидатов в яйцеводах животных, имеющих выраженные различия по изучаемому признаку; выявить возможные корреляции уровней экспрессии генов-кандидатов и количественных
значений ST53; путем частичного секвенирования выявить SNP, по которым различаются аллели генов-кандидатов, влияющие на проявление этого признака. На основе полученных данных предполагается создать систему маркеров для селекции несушек по аллелям генов, оказывающих влияние на толщину скорлупы яйца.
В настоящее время не существует подобной системы в птицеводстве. Аналогичные системы для прямой генной селекции по показателям качества мяса и молока применяют в свиноводстве и молочном животноводстве США и ЕС.
Авторы проекта имеют более чем 15-летний опыт работы в области молекулярной генетики домашней курицы и сравнительной геномики птиц и млекопитающих.