Игорь Памирский » Публикация

Аннотация Методами биоинформатики (in silica) на уровне целых полипептидных цепей и отдельных участков аминокислотных последовательностей установлена (с учетом открытых новых протеинов) степень гомологии внутри групп белков биоминерализации силаффинов, силацидинов и силикатеинов. Для типичных представителей данных белков, а также силиказы (единственный представитель), был произведен поиск гомологов первичной структуры из числа известных пептидов и полипептидов (обработано около 2000 аминокислотных последовательностей). Сходство первичных структур гомологов силаффинов составило 21-94% (E-value от 0 до 5.0×10-6), силацидинов – 45-98% (E-value от 2.0×10-3 до 6.7×10-2), силикатеинов – 39-50% (E-value от 3.0×10-89 до 1.0×10-88), силиказы – 28-40% (E-value от 8.0×10-43 до 1.0×10-17). Проанализировано распределение гомологов по семействам вирусов, а также классам бактерий, растений и животных. Сопоставлены биологические функции исследуемых белков и их гомологов.