Vladimir Poroikov » Публикация

Аннотация Рассмотрена роль диполь-дипольных взаимодействий в формировании вторичной структуры полипептидной цепи. Проведены расчеты проекций дипользого момента пептидной группы на направления вдоль и перпендикулярно оси для всех возможных комбинаций углов "фи" и "пси", характеризующих регулярные конформационные состояния полипептидной цепи. Оказалось, что величины этих проекций существенно различаются для основных типов вторичных структур. Полученные результаты позволяют более ясно представить физические основы формирования вторичной структуры, а также подойти к разрешению вопросов, касающихся определения минимально возможных участков различных типов вторичных структур и допустимой степени их деформации. На основании полученных данных обсуждаются возможные механизмы формирования глобулы белка и объясняется существование меньшего количества классов альфа-спиральных глобулярных белков по сравнению с белками бета-структурного и смешанного типа.