За последние десятилетия СГУ превратился в один из крупнейших вузов России. Были открыты новые факультеты: нелинейных процессов, философский, социологический, факультет компьютерных наук и информационных технологий, нано- и биомедицинских технологий, восстановлены ранее существовавшие в СГУ экономический и юридический факультеты. Создан Поволжский региональный центр новых информационных технологий (ПРЦ НИТ), вобравший в себя лучшие достижения современных информационно-коммуникационных технологий (ИКТ) и ставший плацдармом информатизации Саратова и области. В 1998 году приказом Минобразования РФ в состав СГУ путём присоединения были включены Саратовский и Балашовский пединституты, техникум радиоэлектроники, политехникум и, таким образом, на базе СГУ было положено начало формированию университетского комплекса. В 2006 году в состав комплекса входило 29 факультетов, обучалось 28 тысяч студентов и работало свыше 4 тысяч преподавателей и сотрудников.