Игорь Баскин » Публикация

Поделиться публикацией:

Опубликовано 2011-06-10 Опубликовано на SciPeople2012-02-03 20:43:07 ЖурналИзвестия Академии наук. Серия химическая

Одноклассовый подход: модели для виртуального скрининга ненуклеозидных ингибиторов обратной транскриптазы ВИЧ

П. В. Карпов, И. И. Баскин, Н. И. Жохова, М. Б. Навроцкий, А. Н. Зефиров, А. С. Яблоков, И. А. Новаков, Н. С. Зефиров / Игорь Баскин

Известия Академии наук. Серия химическая, 2011, No. 11, С. 2371-2377.

Аннотация Впервые в рамках одноклассового подхода с использованием метода опорных векторов построены одноклассовые модели для виртуального скрининга потенциальных ненуклеозидных ингибиторов обратной транскриптазы ВИЧ. Обучающая выборка включала данные по 786 структурам производных 2-замещенных пиримидинонов и их ингибирующей активности в отношении фермента для дикого и мутантных (К103, IRLL98,Y188L) штаммов ВИЧ-1. Представление молекулярной структуры органических лигандов на основе непрерывных молекулярных полей позволяет получать классификационные модели более высокого качества по сравнению с традиционными подходами, базирующимися на использовании фрагментных дескрипторов Кархарта, «молекулярных отпечатков» и спектрофоров.